随后马朝云也不再矫揉造作，立即命令振第二旅南下抵御来袭清兵，五千人浩浩荡荡地朝温州开进，同时紧急向革命军运送了一批弹药过去，让革命军一定要阻截住清兵在苍南一带的行动，借助险要地势拖住清兵的进攻。
振的弹药用马车快马加鞭地朝浙南运了过去，当这批补充的弹药到达时，革命军三个营的部队弹药已耗尽，他们最多还能支撑半个月以上，而此时双方的伤亡却并不大，浙南的地势不利于大兵团运动，也不存在如平原战那样的大规模阻击战，双方只是在争夺一些山口、关隘的战斗时会发生激烈战斗，一旦一方抵挡不住，就会放弃一个关口，退守到下一个关口上，这样一攻一守之下，革命军已从苍南退出了二十几公里地，但还在且退且战。
两日后，当振到达苍南地区时，远程榴弹炮再次大显身手，一发发炮弹落在了清兵阵地上，清兵知道振炮火的厉害，一听到炮响便开始退缩，振随后步步紧逼，将清兵一直逼退回了分水关之内，振随之接收苍南等地的防务，在当地建设炮兵阵地，守住各个关键的关口，以防清兵再次北上袭扰，清兵遇到了强大对手，自然暂时歇菜，原地休整起来。
随后革命军宣布自动解体，加入了振编制，至此振在浙江一共收编了两万人，这两万人随后被编成了两个师，为振第三师和第四师，第三师为浙江新军原来的一万人，由童保暄任师，朱瑞任副师，第四师为原旧军改编而成，师由原第一师第一旅旅路羽铮担任，路羽铮此时还在上海，接到命令之后，立即赶赴浙江任命，第四师将作为守备部队留守地方，第一、二、三师将作为主要精锐力量准备应对未来发生的战事。
考虑到新军短时间内无法适应新式的八一式步枪，所以第三师使用的枪支仍然采用老式的汉阳造和德国毛瑟98，但兵工厂储备的榴弹炮和加农炮、迫击炮将划拨八十门给第三师，第三师立即组建成一个榴弹炮营，由第一师派出军官指导，进行短期快速炮兵操作训练，以尽快掌握一百二十二毫米榴弹炮和一百三十毫米加农炮和各型迫击炮的战地操作。
福建清兵见革命军已被振吞并，只得在分水关以南待命，等待北方北洋军向苏南发动进攻，然后再找准时机趁其虚弱疲惫时配合北上作战，或是绕道衢州仙霞岭一带兵进金华，此时在炮火实力大大不如对手的情况下，是难以取得决定性胜利的。
浙江战役的进展神速出乎了国内外多方的意料之外，清廷丢失苏南和上海时，还可以解释为振出其不意的崛起，和武器装备的先进带来的成果，而浙江境内清兵的几乎全盘崩溃就不仅仅是军事力量对比的问题，而是军队的政治倾向问题，是军队没有竭力抵抗，频频倒戈导致的结果。
清廷竭力打造的新式陆军浙江第二十一镇，此时已落入了振之手，被原本一周之前还盘踞在狭小苏南地区的叛军所掌握，从九月八日到九月二十六日，短短的十九天时间，清廷已丢失了苏南和浙江两地，这在历来进行的国内起义战争之中，进展速度还是相当惊人的。
此时福建清兵在振远程炮火的威慑下，暂时不敢北上，而北洋军在山东、直隶、河南、安徽的部队只有安徽一部六千人左右已抵达宜兴城外，其余几部从山东、河南、直隶南下的部队还在行进途中，振利用短暂的间歇，也在积极备战，深挖堑壕、广布雷区，工厂也开打马力，二十四小时不停工地生产各种军需物资，应对接下来战事的需要。
不过除了此前苏南歼灭清兵六千人的大战之外，随后振并没有遇到大规模的战役，因此战争损耗被压缩到了最小的范围内，整个苏南和浙江的战斗结束之后，振阵亡将士不到三百人，枪支损耗只有几十条，火炮仅损失五门，均为被对方炮火击中损坏，另有三门火炮属于自损，失去战斗力而报废，弹药消耗也相对较少，总共消耗的子弹量低于二十万发，炮弹低于五千枚，但加上战时双饷的军饷，阵亡战士的抚恤金，后勤保障等，算起来一个月不到也消耗了将近四十万两银子。
虽然取得苏南和浙江之中，军政府的财政收入会大大增加，但四十万两银子已相当于清政府一年财政收入的二十分之一，浙江和苏南一年的财政收入加起来也在一千万两之内，军政府控制苏南和浙江还不到一个月，这次战事的花费主要不是来源于最近的征税所得，而是工厂利润的结余。
但工厂利润的大部分都必须用于扩大生产之用，加上政府机构各部门开支，医疗机构和教育机构的建设资金等，需要的资金量是十分庞大，划拨出来的军费有限。
现在振已扩充至四万人，军饷也要翻倍，除路羽铮的第四师作为内卫部队，实行正常军饷一个月六块银元的常量发放之外，其它三个师都必须投入到战斗之中，双饷状态要一直延续下去，接下来部队人数还会继续扩编，军费开支将会越来越庞大。
而工厂的扩张并非一朝一夕可以完成的，现在每年利润增加百分之二十至百分之五十之间，速度已经相当惊人了，预计今年年工厂利润受到国内战事的影响，还会打一些折扣，但出口部分在高速增，如今振华一半以上的产品都用于
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